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tRNA^val-shRNA表达框在筛选HBV C基因小干扰RNA靶位中的应用

潘修成; 陈智; 倪勤; 羊正纲; 徐宁; 金晗英 浙江大学学报·医学版 2006年第02期

摘要:目的:以tRNA^val-shRNA表达框技术筛选高效的HBV C基因siRNA靶位。方法:针对HBV C基因序列设定5个siRNA靶位,以一步重叠延伸PCR技术生成含tRNA^val启动子的shRNA表达框(SEC),分别与HBV C基因与EGFP融合表达质粒(pC-EGFP)共转染AD293细胞,转染后48h,流式细胞术检测融合基因荧光表达情况,半定量RT-PCR法检测HBV-C基因mRNA表达水平。以筛选的shRNA表达框转染hepG2.2.15细胞,72h后放免法检测细胞培养上清HbsAg、HbeAg水平,RT-PCR检测细胞HBV pgRNA水平。结果:共转染shRNA表达框能有效抑制融合表达质粒(pC-GFP)荧光强度和HBV C mRNA表达,其中SEC-492i抑制效率最佳,而SEC-282i相对较差。选定的492i表达框(SEC-492i)及282ishRNA表达框(SEC-282i),均呈剂量依赖性抑制hepG2.2.15细胞HbeAg分泌和HBV pgRNA水平,其中SEC-492i抑制HbeAg和HBV pgRNA水平明显优于SEC-282i。结论:在选定的5个siRNA靶位中,以492i靶位RNAi效率最高。tRNA^val-shRNA表达框技术可用于抗HBV高效siRNA靶位的筛选,有进一步推广应用价值。

关键词:肝炎病毒乙型基因shrna表达框小干扰rna

单位:浙江大学医学院附属第一医院传染病研究所; 浙江杭州310003

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浙江大学学报·医学版

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