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丙型肝炎病毒全基因组培养细胞中转录调节基因的差异表达

赵四海 寻萌 楚雍烈 朱彤 华 闫丽鹏 浙江大学学报·医学版 2008年第02期

摘要:目的:利用基因芯片的高通量分析性能和丙型肝炎病毒(HCV)全基因组细胞培养系统,研究HCV对宿主细胞转录调节基因的影响和机制。方法:用人工构建的HCV感染Huh-7肝癌细胞株,待其发生细胞病变后收集培养细胞,以同步培养但不感染HCV的细胞作为阴性对照。提取感染细胞和对照细胞的总RNA、总蛋白和细胞培养上清。总蛋白用于Western blotting鉴定HCV蛋白在感染细胞内的表达情况。细胞培养上清用于检测HCV在感染细胞内合成后的释放情况。总RNA用10g/L琼脂糖凝胶电泳鉴定抽提情况,再纯化后进行逆转录cRNA合成、荧光标记和纯化后用于基因芯片分析,检测宿主细胞转录调节基因的差异表达。培果:在细胞培养上清液中可检测到HCV,感染细胞内可检测到HCV蛋白表达。基因芯片检测2倍差异表达转录调节基因发现,上调基因11个,下调基因11个。培论:HCV全基因组细胞培养系统为研究HCV对感染细胞转录调节基因表达的影响提供了良好工具。利用基因芯片技术,筛选出HCV全基因组细胞培养系统中差异表达的转录调节基因,为研究HCV感染对细胞基因转录的影响提供了重要资料,加深了对HCV和宿主细胞相互作用机制的认识。

关键词:肝炎丙型肝炎病毒基因调节

单位:西安交通大学医学院病原生物学与免疫学系 陕西西安710061 岱鹰生物医药集团股份有限公司 陕西杨凌712100

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