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复杂性疾病遗传研究中Tag SNP的筛选及其潜在功能预测

朱益民; 许玉洋; 凌洁 浙江大学学报·医学版 2011年第03期

摘要:利用公共数据库筛选与复杂性疾病相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)。运用FastSNP、SNP Function Prediction、F-SNP等多种SNP功能预测软件筛选有潜在功能的SNPs;通过HapMap等数据库筛选Tag SNP;综合比较各软件结果。以IGFBP 7基因为例,筛选转录因子结合位点SNPs 11个,内含子增强子31个,内含子增强子和转录因子结合位点4个,剪接位点1个,共47个SNPs。

关键词:多态性单核苷酸转录因子数据库文献型

单位:浙江大学公共卫生学院流行病学与卫生统计学系

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浙江大学学报·医学版

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