摘要:目的:构建瞬时受体电位M8型(TRPM8)离子通道选择性滤器结构域的三维结构模型。方法:在Rosetta计算结构生物学工具包中,使用基于运动回路闭合算法的从头计算,对TRPM8离子通道选择性滤器结构域进行多轮计算建模。结果:经过9轮计算得到了能量最低且结构收敛的TRPM8通道选择性滤器结构域的三维结构模型,发现D918位点的侧链并不指向离子流过的孔区中心,而Q914、D920和T923位点的侧链指向孔区中心;糖基化位点N934位于孔区外侧,其侧链指向胞外水环境。结论:构建了TRPM8通道选择性滤器结构域的三维结构模型,为理解该通道的离子选择性及相关机制提供了较为可靠的结构信息。
关键词:瞬时受体电位通道 trpm阳离子通道 氨基酸序列 计算机模拟
单位:浙江大学医学院生物物理系; 浙江杭州310058
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