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贵阳地区2013年手足口病非EV71、非CVA16型肠道病毒的检测分析

杨兴林; 梁跃东; 洪章萍; 熊金凤; 王云芬; 黄海 重庆医学 2016年第17期

摘要:目的了解贵阳地区引起手足口病(HFMD)的非肠道病毒71型(EV71)、非柯萨奇病毒A(CVA)16型肠道病毒的病原构成及优势型别,为贵阳地区HFMD防治工作提供依据。方法收集2013年4~6月检测为非EV71、非CVA16型肠道病毒的HFMD患者肛拭子标本共107例。提取病毒核酸,用巢式RT-PCR法扩增病毒VP4区序列,对PCR阳性扩增产物进行测序,通过与GenBank收录的序列BLAST比对确定病毒型别;并对优势型别进行序列和进化分析。结果 107例标本中共有100例标本巢式RT-PCR检测为阳性(93%),其中100例PCR产物测序成功,经BLAST比对后,100例标本病毒型别均得到确定:CVA6为46例,CVA10为30例,CVA5为10例,CVA2为6例,CVA3和CVA4各2例,CVB2和ECHO16各2例。CVA6在型别确定的非EV71、非CVA16型肠道病毒中占42.99%,为优势肠道病毒型别。结论贵阳地区引起HFMD的肠道病毒型别多样,CVA6为非EV71、非CVA16型肠道病毒中的优势型别。

关键词:手足口病肠道病毒基因型

单位:贵州省贵阳市第五人民医院检验科; 550004; 贵阳医学院检验系; 贵阳550004

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