摘要:目的 探讨mmu--miR-3475-3P可能参与的生物学过程及信号通路。方法 用实时荧光定量PCR方法测定mmumiR-3475-3P在小鼠胚胎心脏和成熟心脏中的表达。再综合应用TargetScan、miRDB、miRanda等常用microRNA在线数据库对miR3475-3p进行靶基因预测,对所得靶基因进行基因功能注释(Go)和信号通路分析。结果 mmu-miR-3475-3P在小鼠胚胎心脏和成熟心脏中存在明显的表达差异,运用TargetScan、miRDB、miRanda对miR3475-3P进行生物信息学分析发现该microRNA可能调控441个靶基因。结论 mmu-miR-3475-3P在小鼠胚胎心脏高表达,其预测的靶基因富集于多个信号通路及细胞生物学过程。
关键词:生物信息学 靶基因 心脏发育
单位:重庆医科大学附属儿童医院心内科; 重庆400014; 西南医科大学附属医院儿二科; 四川泸州646000
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