摘要：目的 利用二代测序技术对FFPE标本进行高通量测序及相关的生物信息学分析,探讨miRNAs在来源于石蜡包埋胃癌组织（FFPE）中的标本检测的可靠性,探讨其临床意义。方法 选取2015年和2016年2例胃癌患者手术切除同一组织的FFPE和新鲜冰冻标本,从标本中提取RNA并分离构建small RNA文库,采用Illumina测序平台测序的方法对其进行高通量测序,统计各已知miRNAs家族序列的表达量,构建已知miRNAs表达谱,对标本miRNAs进行Spearman相关性分析,评估miRNAs表达量的差异变化情况。结果 新鲜冰冻标本中提取的总RNA质量较高,RNA保存度完整,显示28S是18S的1.3-1.4倍,从石蜡组中提取的RNA,结果显示有不同程度的降解,28S和18S的波峰不明显,miRNAs表达谱在冰冻和FFPE标本中,Spearman相关系数分别为0.90和0.86,两者miRNAs表达量较一致,具有相关性。结论 FFPE中的miRNAs仍然保持一定的完整性,且可通过二代测序进行肿瘤标本检测。

关键词：胃肿瘤 mirna 甲醛固定石蜡包埋 二代测序 

单位：江西中医药大学基础医学院; 江西南昌330004; 江西中医药大学附属医院骨四科; 江西南昌330006; 南昌大学第一附属医院老干科; 江西南昌330006