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miRNA-32启动子区域相互作用蛋白的分析

吴巍芸 重庆医学 2019年第10期

摘要:目的检测及分析与微RNA-32(miRNA-32)基因上游启动子区域相互作用的蛋白。方法采用DNA pulldown技术联合质谱鉴定的方法检测miRNA-32启动子区域相互作用的蛋白,并用生物信息学方法对这些蛋白进行GO富集及KEGG通路分析。结果在大肠癌HCT-116细胞中总共鉴定到191个与miRNA-32启动子区域特异性结合的蛋白。GO功能富集分析显示,这些蛋白涉及多种生物学功能,包括参与核酸代谢、基因转录、细胞周期、细胞生长和再生等过程。KEGG通路分析表明这些蛋白参与多条信号通路,包括间隙连接、细胞周期信号通路、MAPK信号通路等。结论与miRNA-32启动子区域有相互作用的蛋白具有多种生物学功能及参与多条信号通路。

关键词:质谱分析法启动子dnapulldowngo富集

单位:广东医科大学附属医院消化内科; 广东湛江524001

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