摘要：以不同来源大豆种质为材料进行基因组SSR分析，探讨大豆遗传多样性研究方法，旨在为科学评价大豆种质资源提供参考。当取样比例相同时，湖北大豆的遗传丰富度显著高于湖南大豆，但两省大豆遗传多样性指数之间没有显著差异。当取样量相同时，利用随机取样法比较，湖南大豆的遗传多样性显著高于湖北，而利用聚类取样比较，两省大豆的遗传多样性没有显著差异。在遗传多样性指数相同情况下，湖北大豆的遗传丰富度显著高于湖南大豆。取样数与三个遗传多样性评价参数（等位变异数、Shannon指数、He）之间均达到显著和极显著相关。以湖南大豆为例，估算出在大豆SSR遗传多样性分析中，至少需要50．60个样本，即占总体9．0％。10．8％的取样比例，才能代表总体的遗传变异。提出在评价大豆遗传多样性时，应用大豆样本数对其遗传多样性指数计算公式进行修正，建议将Shannon指数计算公式改为H=-lnN∑PiInPi（N为样本数）。根据修正公式分析，结果表明，湖北大豆的遗传多样性高于湖南大豆。

关键词：大豆 遗传多样性 ssr标记 shannon指数 期望杂合度 

单位：中国农业科学院作物科学研究所/国家农作物基因资源与遗传改良重大科学工程; 农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室; 北京100081; 新疆农业大学; 新疆乌鲁木齐830052; 东北农业大学/教育部大豆生物学重点实验室; 黑龙江哈尔滨150030