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巴西橡胶树SNARE蛋白全长cDNA克隆及其序列特征分析

邓柳红; 罗明武; 张春发 作物学报 2007年第05期

摘要:从巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)差减cDNA文库中筛选到一个与SNARE蛋白同源性较高的基因片段,根据其序列信息设计特异引物,采用cDNA末端快速扩增技术RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)进行差异片段的5’和3’端的扩增,获得了长度为1070bp的全长cDNA克隆R295。序列分析表明该基因包含600bp的开放阅读框,5'-UTR为93bp,3'-UTR为377bp,编码199个氨基酸。该基因编码的蛋白具有一个SNARE coiled—coil保守区、一个典型的VAMP基元及一个羧基端的CAAX基元。同源分析表明该蛋白属于一类特殊的longins蛋白。RT-PCR检测表明它在胶乳中特异表达,在叶中没有表达。

关键词:巴西橡胶树胶乳snares蛋白ykt6

单位:中国热带农业科学院热带生物技术研究所; 海南海口571101; 华南热带农业大学; 海南儋州571737

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