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利用不同实时定量PCR方法分析相对基因表达差异

余舜武; 刘鸿艳; 罗利军 作物学报 2007年第07期

摘要:利用实时荧光定量PCR方法分析目标基因转录本之间的表达差异,目前常用的分析实验数据的有绝对定量和相对定量方法。为了克服绝对定量方法的繁琐和简化相对定量的分析方法,分别利用2-ΔΔCt、2-ΔCt和标准曲线法对水稻OsRDB1基因在不同化学试剂和激素处理下的表达差异进行了分析,发现2-ΔΔCt必须引入标准的看家基因作为参考,计算方法繁琐,计算结果受扩增效率影响;而利用2-ΔCt和标准曲线法计算方便,节省定量PCR试剂,但其结果易受到RNA浓度测量准确率的影响,其中标准曲线法引入斜率消除扩增效率的影响,最能测得实际的原始拷贝数差异。

关键词:相对定量标准曲线实时荧光定量pcrosrdb1

单位:上海市农业生物基因中心/作物遗传改良国家重点实验室种质资源分室(上海); 上海201106; 华中农业大学; 湖北武汉430070

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