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栽培稻种内核糖体基因的ITS序列比较研究

戴小军; 梁满中; 陈良碧 作物学报 2007年第11期

摘要:以普通野生稻(O.rufipogon)为外类群,对栽培稻(O.sativa)籼亚种(O.sativassp.indicn)和粳亚种(O.sativassp.japonica)18个材料的核糖体基因(rDNA)内转录间隔区(intemal transcribed spacers,ITS)全序列进行比较分析。供试材料中有籼亚种品种(系)9个,粳亚种品种(系)6个,爪哇稻2个和陆稻1个。结果发现,栽培稻种内总变异位点23个,占总碱基数的5.41%;8个信息位点,占总碱基数的1.82%。籼亚种ITS全序列的长度为425~430bp,G+C含量为74.25%~75.59%;粳亚种ITS序列总长度为425bp,G+C含量为74.25%~75.59%。以ITS全序列构建的系统树能将栽培稻区分为籼、粳2个亚种群,爪哇稻与籼稻有较近的亲缘关系,这对研究栽培稻的演化有+定的指导意义。

关键词:栽培稻核糖体内转录间隔区系统树

单位:湖南师范大学生命科学学院; 湖南长沙410081

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