摘要：根据GenBank中公布的247条草棉EST序列，搜索SSR并进行引物设计。其中的25条序列含有27个SSR，1～6碱基重复类型都存在，二碱基和三碱基重复的频率较高。为了明确在A、D和AD基因组中的可转移性，依据25条序列共设计25对EST—SSR引物，其中22对引物扩增出清晰可辨的DNA条带，产生92个多态性片段，平均每对引物产生3．64个多态性片段。引物的多态性信息含量（PIC）在0．49～0．91之间，平均为0．81。6对引物在BC．种间作图群体[（鄂棉22×Pima3—79）×鄂棉22]中表现多态性，产生7个多态性位点，其中5个为共显性，2个为显性。除HAU230b标记在BC1分离群体中不符合孟德尔式分离比例，其余引物表现正常分离。6个位点被整合到陆地棉和海岛棉种间BC1遗传连锁图谱上的6条染色体：有4个位于A亚基因组的4条染色体上（Chr．6、10、11和12），2个位于D亚基因组的2条染色体（Chr．19和20）。

关键词：草棉 表达序列标签 简单序列重复 多态性信息含量 遗传作图 

单位：华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室; 湖北武汉430070; 新疆农垦科学院棉花所; 新疆石河子832000