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玉米自交系B73全基因组NBS类型抗病基因分析

汪结明; 江海洋; 赵阳; 项艳; 朱苏文; 程备久 作物学报 2009年第03期

摘要:核苷酸结合位点(NBS)类型抗病基因是植物抗病基因中最大的一个类别,也是近年来植物抗病分子育种研究的一大热点。本研究对玉米自交系B73全基因组中含有NBS结构的候选抗病基因进行了基因总数、类型、系统进化关系等分析。在B73全基因组中含有165个NBS结构的基因,远远少于水稻中的同类基因,按照N-端结构和亮氨酸富集区(LRR)结构,将其分为153个标准结构和12个非标准结构NBS基因。其中,标准结构基因又分为CC—NBS—LRR、CC—NBS、NBS、NBS—NBS、NBS—LRR、NBS—NBS—LRR、NBS—X、X—NBS等8个类型。系统进化树分析表明,NBS类型抗病基因存在明显的两大分支,与水稻的星状发散型分布有很大差异。通过基因家族分析,还发现了玉米NBS类型基因的复制现象,但发生复制的基因比例低于水稻,可能是造成玉米NBS抗病基因数目较少的原因之一。

关键词:玉米生物信息学抗病基因系统进化树

单位:安徽农业大学生命科学学院; 安徽合肥230036

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