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应用基因芯片分析红蚰麦白粉菌胁迫条件下的基因表达谱

王俊美; 刘红彦; 徐红明; 王飞; 高素霞; 康振生 作物学报 2009年第07期

摘要:小麦农家品种红蚰麦携带1对显性抗白粉病新基因,暂命名为Pmhym。为了深入了解该品种抗病的分子机制,用豫麦13/红蚰麦的F3代纯合抗病株系构建抗池,采用Affymetrix小麦基因芯片技术,以白粉菌接种0h为对照,分析白粉菌接种后24h的基因表达谱。在61127基因微矩阵点中,有效差异表达Ratio值≥2或≤0.5的基因共5282个,其中上调基因2553个,下调2729个。对上调序列的分类表明,功能明确的序列中39.81%与抗病/防御相关;下调表达基因中以能量代谢和抗病/防御相关基因比例最高,分别占26.71%和19.65%。上调表达在8倍以上的序列中81个的功能已知,其中包括病程相关基因、防卫反应基因、生成或清除活性氧的基因,以及抗病信号转导基因等。选取上调和下调表达8倍以上的共13个探针序列进行实时定量PCR验证,表明基因芯片数据具有良好的重复性。

关键词:小麦抗白粉病基因基因芯片表达序列标签实时定量pcr

单位:河南省农业科学院植物保护研究所; 河南郑州450002; 西北农林科技大学植保资源与病虫害治理教育部重点开放实验室; 陕西杨凌712100; 西北农林科技大学陕西省农业分子生物学重点实验室; 陕西杨凌712100

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