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海南普通野生稻(Oryza rufipogon Griff.) Adh2基因多态性分析

董轶博; 裴新梧; 袁潜华; 彭于发 作物学报 2009年第11期

摘要:海南岛的4个保护区和2个非保护区内普通野生稻与2种栽培稻(Nipponbare,9311)的Adh2基因序列在编码区共有单现突变9个,信息位点4个,同义突变8个,替代突变5个。内含子内有单现突变21个,信息位点29个,插入/缺失位点161个。Adh2基因在整个区域的多态性(πR,θR)均为0.011,内含子区域的多态性明显高于编码区域。在编码区域,同义位点多态性明显高于替代位点。中性测试表明虽然Adh2各区域的净化选择在统计上不具有显著性,但编码区的净化选择作用明显大于内含子区域。聚类分析表明海南普通野生稻可以划分为2大类,其中一类(QH,LD)与中国大陆普通野生稻和栽培稻更接近,另一类(WC,WA,WN,DZ)则更接近东南亚普通野生稻。

关键词:普通野生稻adh2序列多态性

单位:中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室; 北京100094; 中国农业科学院生物技术研究所; 北京100081; 海南大学生命科学与农学院热带生物资源教育部重点实验室; 海南海口570228

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