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陕253γ-醇溶蛋白基因的克隆与序列分析

王明霞; 高翔; 陈其皎; 董剑; 赵万春; 李艳亮; 李敏; 陈瑞估; 庞红喜; 李哲清; 刘俊 作物学报 2010年第03期

摘要:针对γ-醇溶蛋白基因家族成员,设计了覆盖其启动子及全长编码区的3对特异引物,从强筋小麦品种陕253中克隆了8条1000bp左右的片段(GenBank登录号为GQ871770~GQ871777)。该片段群包含典型醇溶蛋白亚基的完整编码序列,并在重复区存在丰富的插入/缺失(InDel);推导的氨基酸序列显示,8个基因均具有γ-醇溶蛋白亚基的典型结构特征,其中GQ871771为假基因,4条序列(GQ871770、GQ871772、GQ871776和GQ87177)具有9个半胱氨酸残基;启动子区序列分析表明,GQ871770、GQ871772、GQ871774和GQ871776在胚乳框存在6处SNP变异,其中两处变异发生于GCN4基序内,利用WebLogo3在线构建了储藏蛋白更具代表意义的30bp保守胚乳盒模式。进化分析证实克隆序列属于γ-醇溶蛋白基因家族成员。

关键词:普通小麦基因克隆序列分析

单位:西北农林科技大学农学院; 陕西省小麦工程技术研究中心/陕西省小麦新品种培育工程研究中心; 陕西杨凌712100

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