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高粱全基因组生长素原初响应基因Aux/IAA的序列特征分析

王益军; 吕燕萍; 谢秦; 邓德祥; 卞云龙 作物学报 2010年第04期

摘要:生长素在生物体的生长、发育与分化过程中发挥着重要作用。Aux/IAA基因家族在生长素诱导的早期做出响应,是生长素早期应答的三大基因家族之一。采用生物信息学的方法,对高粱全基因组Aux/IAA基因进行序列特征分析表明,高粱基因组中共有25个Aux/IAA基因,分布于高粱9对染色体,在高粱第6号染色体上未发现Aux/IAA基因。序列比对与系统发生分析表明,22个(88%)高粱Aux/IAA蛋白具有4个保守结构域,19对高粱/玉米Aux/IAA蛋白、2对高粱/水稻Aux/IAA蛋白处于系统进化树的同一分支。该研究结果不仅有助于生长素信号转导通路的解析,而且可以为其他作物基因家族的研究提供参考。

关键词:高粱生长素比较基因组学

单位:扬州大学农学院/作物遗传生理江苏省重点实验室/植物功能基因组学教育部重点实验室; 江苏扬州225009

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