摘要：采用同源序列法对6个芥菜型油菜（Brassica juncea）品种（高芥酸、中芥酸、低芥酸）、2份白菜型油菜品种（高芥酸和低芥酸）和1份黑芥品种的FAE1基因进行克隆和测序表明，9个品种的FAE1基因编码区全长均为1 522 bp，不含内含子，均编码507个氨基酸残基。序列比较表明，芥菜型油菜中有两种FAE1基因序列（BjFAE1.1和BjFAE1.2），其亲缘种白菜型油菜和黑芥中各有一种FAE1基因序列（BrFAE1和BnFAE1）, BjFAE1.1对应于白菜型油菜的BrFAE1, BjFAE1.2对应于黑芥BnFAE1；BjFAE1.1和BjFAE1.2之间存在71处核苷酸变异和Hind III不同的酶切位点（第1415位和第1144位）, 蛋白质水平上存在15处氨基酸变异。比较不同芥酸含量品种的FAE1基因序列表明，BjFAE1.1基因存在2个SNP位点（第968位和第1265位）, BjFAE1.2基因也有2个SNP位点（第49位和第237位），这4个SNP位点中有3个位点（第49位、第968位和第1 265位）导致蛋白质水平上氨基酸的差异。其中BjFAE1.1基因第968位的碱基变化（C→T）引起的第323位氨基酸变化（Thr→Ile），能够解释芥菜型油菜和白菜型油菜高芥酸到低芥酸（中芥酸）的转变；第1265位的碱基变化（T→C）引起的第422位的氨基酸变化（Phe→Ser），能够部分解释芥菜型油菜的高芥酸到低芥酸（中芥酸）的转变，白菜型油菜的高芥酸和低芥酸品种在该位点的碱基没有变化。BjFAE1.2基因第49位的碱基变化（T→C）引起的第17位氨基酸的变化（Phe→Leu），可以解释芥菜型油菜的中芥酸变成高芥酸（低芥酸）。陕西黄芥低芥酸突变株1278-3的FAE1基因序列和国外低芥酸品种比较，只在第1 265位出现变异。

关键词：芥菜型油菜 fae1 克隆 序列分析 

单位：华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室; 湖北武汉430070; 西北农林科技大学农学院; 陕西杨凌712100