摘要：利用SSR分子标记和ITS序列分析研究Ceratotropis亚属已鉴定的93份种质以及Vigna亚属的2份地方种和Glycine属的1份野生种,共8个种及亚种的96份材料的遗传差异。初步筛选出分布于11个连锁群（linkage group,LG）的74对小豆引物及14对黒吉豆引物和第9连锁群的5对绿豆引物,得到分辨力强的27对引物,平均PIC值为0.4914;UPGMA聚类分析,在DICE系数0.021处,将95份参试材料（除HAI_103）划分为两大类,第I类包括Ceratotropis组所有种质和3个＂过渡＂种质;第Ⅱ类包括Angulares组所有种质,且小豆引物通用性最高,23对小豆引物的转移能力达88%以上。对参试材料中的28份典型种质进行ITS测序分析,比较序列间Kimura进化距离发现,V.minima和V.umbellata种间距离最小（0-0.005）,V.radiata种内分化程度最高;利用MEGA4.0构建最大简约树（maximum parsimony,MP）和邻接树（neighbor-joining,NJ）,将参试种质划分为3大类,这与形态学和SSR标记分类一致。

关键词：ceratotropis亚属 分类 ssr标记 its序列 进化 

单位：中国农业科学院作物科学研究所; 北京100081