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ET-ISJ标记的开发及陆地棉遗传图谱构建

林刚; 张轲; 张建; 滕中华; 张正圣 作物学报 2011年第01期

摘要:根据植物结构基因外显子拼接位点的保守序列,设计扩增外显子的ET-ISJ(exon targeted intron-exon splice junction)标记引物。利用1 280对ET-ISJ引物组合,对陆地棉品种渝棉1号和T586进行多态性筛选,获得69对多态性引物组合,占引物组合的5.4%。用多态性ET-ISJ引物组合检测(渝棉1号×T586)F2:7重组近交系群体,得到70个位点。以70个ET-ISJ标记位点与523个SSR、59个IT-ISJ、29个SRAP和8个形态标记进行连锁分析,构建的遗传连锁图谱包括59个连锁群和673个位点(68个ET-ISJ、510个SSR、58个IT-ISJ、29个SRAP和8个形态标记)。连锁图覆盖3 216.7 cM,约占棉花基因组的72.3%,标记间平均距离为4.8 cM。68个ET-ISJ标记分布于20条染色体。研究表明ET-ISJ标记多态性较高、稳定性好,可有效用于棉花与其他植物遗传连锁图谱构建。

关键词:陆地棉遗传图谱

单位:西南大学农学与生物科技学院/农业部生物技术与作物品质改良重点开放实验室; 重庆400716

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