摘要：从回交近交系（backcross inbred lines,BIL）群体中选取纤维长度差异较大的两个系NMGA-062（33.03 mm）和NMGA-140（25.87 mm）,利用Affymetrix棉花基因芯片,分析其开花后10 d（DPA,days post anthesis）棉纤维伸长相关基因表达谱。在24 029条转录本中,两材料间差异表达的转录本有7 282条,占总数的30.31%;其中差异表达倍数在2倍或2倍以上的转录本有3 993条,占筛选转录本总数的16.62%,功能分类表明这些转录本主要包括功能预测基因（15.57%）,翻译、核糖体结构相关基因（13.54%）和翻译后修饰、蛋白质转换相关基因（9.29%）3大类。为了验证芯片数据的可信性,8个差异表达显著的基因（Ghi.10655.1.S1_s_at,ACO1,ARF1,SAHH,TUA6,TUA7,β-tub1,β-tub10）被用于实时荧光定量PCR。两种检测手段表现出一致性。随后,利用实时荧光定量PCR对3个与棉纤维相关基因（ARF1,β-tub1,β-tub10）在纤维发育不同时期（5、10、15、20和25 DPA）的表达模式进行了研究,结果表明,3个基因在纤维伸长发育时期（10和15 DPA）大量表达,推测这3个基因可能与棉纤维伸长有重要关系。

关键词：基因芯片 纤维伸长相关基因 差异表达基因 实时荧光定量pcr 

单位：中国农业科学院棉花研究所／农业部棉花遗传改良重点实验室; 河南安阳455000; 西北农林科技大学农学院; 陕西杨凌712100; 美国新墨西哥州立大学植物与环境科学部; 美国新墨西哥州80003