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TMV侵染烟草基因差异表达的cDNA-AFLP分析

陈荣平; 刘磊; 万秀清; 邱恩建; 王春军; 宋宝刚; 颜培强; 杨铁钊 作物学报 2012年第01期

摘要:以烤烟品种龙江925[高抗烟草普通花叶病(TMV)]接种TMV的叶片为材料,选用240对引物组合的扩增,获得约9500个转录基因片段,经过克隆测序最终获得了12个诱导表达片段,它们与核酸代谢、蛋白质合成与修饰、能量代谢、胁迫响应、细胞内运输、糖代谢等相关。利用荧光定量PCR分析诱导表达片段TIF2在0~72h之间5个时间点(0、12、24、48和72h)的基因差异表达,证实了所获得的基因序列为真实诱导的表达序列。对此序列进行RACE,最终获得全长cDNA序列,全序列857bp,预测的编码区在101~613bp之间,共编码170个氨基酸。经Blastn、Blastp比对分析,在烟草中没有获得其同源序列,确定该基因是在烟草中发现的与抗TMV相关的新基因。

关键词:烟草tmv差异基因表达

单位:河南农业大学烟草学院; 河南郑州450002; 黑龙江省烟草公司牡丹江烟草科学研究所; 黑龙江牡丹江157011; 牡丹江市疾病防控中心; 黑龙江牡丹江157022

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