摘要：为揭示小麦自然群体干旱胁迫条件下旗叶叶绿素含量的变化，筛选相关标记的优异等位变异，以262份小麦种质资源组成的自然群体为材料，分别种植在北京的2个试验地点，均设雨养和灌溉处理，于开花期和灌浆期检测旗叶叶绿素含量。以分布于2l条染色体的169个SSR标记检测所有材料的基因型，利用STRUCTURE2．3．2软件分析群体结构，用TASSEL软件的MLM（mixedlinearmodel）方法对小麦自然群体的旗叶叶绿素含量进行关联分析。在此基础上，将携带某等位变异的所有材料表型均值与携带无效等位基因（nullallele）材料表型均值比较，估计等位变异的表型效应，鉴别优异等位变异。共检测到2048个等位变异，每位点2-37个等位变异，平均12个。每位点的标记多态性信息量（PIC）为0．008-0．936，平均0．628。在22个标记位点共检测出40个（次）与旗叶叶绿素含量极显著的关联，其中11个标记位点有2次以上的关联，Xwmc419-1B和Xgwm501-2B分别有3次关联。在Xcfa2123-7A、碌wm232-JD和Xgwm429-2B位点分别检测到效应值大于4．0的等位变异。

关键词：小麦 叶绿素含量 ssr 关联分析 等位变异 

单位：山西农业大学; 山西太谷030801; 中国农业科学院作物科学研究所; 农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程／农业部作物种质资源利用重点开放实验室; 北京100081; 国家谷子改良中心／河北省农林科学院谷子研究所; 河北石家庄050031