线上期刊服务咨询,发表咨询:400-808-1701 订阅咨询:400-808-1721

干旱胁迫下油菜消减文库的构建及分析

谢小玉; 张兵; 张霞; 马仲炼; 李加纳 作物学报 2013年第04期

摘要:以抗旱能力强的油菜Holiday为材料,以干旱处理的样品为Tester,正常水分管理(对照)为Driver构建干旱诱导的甘蓝型油菜叶片正向抑制性消减杂交(SSH)文库。随机挑选24个阳性克隆进行PCR验证,结果表明,其中23个含有插入片段,平均大小在750bp左右。将96个阳性克隆测序,运用CAP3 Sequence Assembly Program聚类、拼接和去除冗余,获得重叠群4条,单拷贝序列82条,平均长度为542bp。经BlastX程序比对蛋白数据库发现,11条EST没有找到同源性序列,75条有同源序列。KOBAS分析发现,28条EST被定位到67条代谢途径中,根据P值推测,光合中的碳固定、有氧呼吸的电子供体、氮代谢、乙醛酸和二羧酸代谢在植物干旱胁迫中发挥着极为重要的作用。这些EST涉及到的功能中所占比例最大的分别是细胞器(58.82%)、结合(30.77%)和新陈代谢过程(43.72%),表明甘蓝型油菜受到干旱胁迫时,细胞器组件上的功能发挥了重要的作用,结合基因和蛋白被激活,加强了新陈代谢。

关键词:油菜抑制差减杂交干旱胁迫cdna文库表达序列标签

单位:西南大学农学与生物科技学院/南方山地农业教育部工程研究中心; 重庆400716

注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社

作物学报

北大期刊

¥1056.00

关注 20人评论|1人关注