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粗山羊草全基因组Aux/IAA基因家族的分离、染色体定位及序列分析

乔麟轶; 李欣; 畅志坚; 张晓军; 詹海仙; 郭慧娟; 李建波; 常建忠; 郑军 作物学报 2014年第12期

摘要:生长素是植物生长发育过程中的关键激素之一,Aux/IAA家族基因是重要的生长素原初响应基因。通过生物信息学方法从粗山羊草(Aegilops tauschii)全基因组中分离出28个Aux/IAA基因,其中20个粗山羊草Aux/IAA蛋白具有4个保守结构域;28个Aux/IAA基因分布于全部7对染色体上,5个基因分别具有位于同一位点的已知标记。粗山羊草IAA3、IAA11和IAA26的表达具有组织特异性,分别在雌蕊、种子和根中特异表达。系统发育显示,11对粗山羊草-乌拉尔图小麦Aux/IAA蛋白、5对粗山羊草-大麦Aux/IAA蛋白直系同源。共线性分析表明,粗山羊草Aux/IAA基因与短柄草、水稻中同源基因具有很好的共线性。本研究分离的相关基因不仅可用于小麦的遗传改良,也为深入研究小麦Aux/IAA基因提供了信息。

关键词:粗山羊草生长素染色体定位生物信息学

单位:山西省农业科学院作物科学研究所/农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室; 山西太原030031; 山西大学研究生院; 山西太原030006; 山西省农业科学院小麦研究所; 山西临汾041000; 山西省农业科学院旱地农业研究中心; 山西太原030006; 山西大学研究生院; 山西太原030006

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