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陆地棉Ghkinesin13亚家族基因的克隆及表达特征分析

赵兰杰 薛飞 朱守鸿 李艳军 刘永昌 孙杰 作物学报 2015年第04期

摘要:Kinesin家族是一类马达蛋白,它们能利用ATP水解所释放的能量驱动自身携带物质分子沿着微管运动,在细胞形成、细胞伸长等方面起着关键作用。本研究以拟南芥Atkinesin-13A蛋白序列作为探针序列,利用Blast比对从二倍体雷蒙德氏棉的基因组数据库中发现7个具有较高同源关系的基因。根据基因序列设计引物,利用RT-PCR技术从陆地棉纤维中分离出7个基因。依据7个基因与Atkinesin.13A和Atkinesin-13B的同源性高低,依次将其命名为GhKISl3A1、GhKISl3A2、GhKISl3A3、GhKISl381、GhKISl382、GhKISl383和GhKISl384。生物信息学分析表明,7个Ghkinesinl3均含有典型的KISC马达区域、ATP结合位点和微管结合位点,其马达区域属于中央马达。多重序列比对和进化树分析发现,这7个蛋白可被分为2个(Kinesinl3A和Kinesinl3B)亚类。实时荧光定量PCR结果表明,7个Ghkinesinl3亚家族基因在棉花各组织中均有表达,但表达模式各不相同,其中GhKISl384在纤维中优势表达,表明其在纤维发育过程中可能发挥着重要作用。

关键词:棉花纤维驱动蛋白表达分析

单位:石河子大学生命科学学院 新疆石河子832003 石河子大学农学院、新疆生产建设兵团绿洲生态农业重点实验室 新疆石河子832003

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