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甘蓝型油菜株高性状的全基因组关联分析

唐敏强 程晓晖 童超波 刘越英 赵传纪 董彩华 于景印 马小艮 黄军艳 刘胜毅 作物学报 2015年第07期

摘要:适当的株高不仅是抗倒性和机械化收获的需要,而且是建立高产理想株型的需要。本研究测定来自世界油菜主产国的371份种质资源材料构成的自然群体的株高,利用60K SNP芯片对该群体进行基因型检测,获得了21 856个SNP,利用这些SNP和株高数据进行全基因组关联分析,结果表明:(1)检测到4个与株高显著关联的SNP,即Bn-A07-p3583161、Bn-scaff_22790_1-p1271170、Bn-scaff_20735_1-p42779和Bn-scaff_18702_1-p589589,分别分布于A07、C01和C02染色体;它们对表型变异的解释率分别为11.33%、11.75%、12.31%和10.97%;(2)参考基因组信息,在上述前3个SNP附近的492.0、9.5和69.5 kb处分别找到一个与株高性状相关的候选基因;(3)4个显著SNP各自的等位基因间表型均值差异分别为11.09、15.12、10.48和8.93 cm,双尾t测验结果表明各等位基因组间差异显著。

关键词:甘蓝型油菜全基因组关联分析snp株高候选基因

单位:中国农业科学院油料作物研究所/农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室 湖北武汉430062 湖北大学/生物资源绿色转化湖北省协同创新中心 湖北武汉430062

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