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青稞遗传多样性及其农艺性状与SSR标记的关联分析

孟亚雄 孟祎林 汪军成 司二静 张海娟 任盼荣 马小乐 李葆春 杨轲 王化俊 作物学报 2016年第02期

摘要:利用92个SSR标记对108份青稞亲本材料进行多态性扫描,分析其遗传多样性,旨在寻找与农艺性状相关联的分子标记,为青稞杂交组合的配制及分子标记辅助育种提供依据。挑选48个多态性标记进行群体遗传结构分析,在此基础上采用Tassel 2.1 GLM(general linear model)和MLM(mixed linear model)方法进行标记与农艺性状的关联分析。共检测出156个等位变异,每个位点2~6个等位变异。供试群体的Shannon指数为0.6727~1.1368,材料间遗传相似系数为0.2250~1.0000,平均0.7585。通过群体遗传结构分析将供试材料划分成4个亚群。以GLM分析,发现12个与株高、穗长、穗粒数和分蘖数相关联的标记,对表型变异的解释率分别为11.5%~17.6%、19.4%~45.4%、15.4%~22.1%和29.2%;以MLM分析,发现8个与株高、分蘖数和小穗数相关的标记,各标记对表型变异的解释率分别为31.7%~49.8%、28.1%~37.2%、22.7%~32.7%。关联标记分布在基因组全部6个连锁群上。

关键词:青稞ssr遗传多样性群体遗传结构关联分析

单位:甘肃省干旱生境作物学重点实验室/甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室 甘肃兰州730070 甘肃农业大学农学院 甘肃兰州730070 甘肃农业大学生命科学技术院 甘肃兰州730070

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