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利用简化基因组技术分析甘薯种间单核苷酸多态性

石璇; 王茹媛; 唐君; 李宗芸; 罗永海 作物学报 2016年第05期

摘要:选用Xushu 18(6x)和Nancy Hall(6x)、2个二倍体I.trifida(2x)品系(4597-10和4597-21)、四倍体I.trifida(4x)、六倍体I.trifida(6x)、二倍体I.temussima(2x)和I.littorallis(2x)以简化基因组测序技术SLAF-seq测序,获得724 589个SLAF标签,其中多态性SLAF标签35 310个。通过序列分析,获得40 765个有效单核苷酸多态(SNP),并用这些SNP分析了8个种质的群体结构和系统发生树。结果表明,利用简化基因组测序技术SLAF-seq能高效、低成本地开发出大量可用于群体遗传分析的SNP标记;通过构建进化树发现甘薯栽培种和野生种I.trifida的亲缘关系比较近。这些分析结果为进一步研究甘薯栽培种的起源提供了基础数据。

关键词:甘薯分子标记snp进化分析

单位:江苏师范大学生命科学学院; 江苏徐州221116; 中国农科院甘薯研究所/国家甘薯改良中心; 江苏徐州221121

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