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籼粳稻基因组295个InDel标记的开发

初志战; 郭海滨; 曾栋昌; 刘耀光 作物学报 2016年第06期

摘要:插入/缺失(InDel)分子标记具有使用简单,结果清晰可靠的优点。本研究通过比对粳稻品种日本晴和籼稻品种93-11的基因组序列,在全基因组范围内设计了634对InDel候选标记,通过PCR检测比较2种粳稻(日本晴和台中65)和2种籼稻(93-11和黄华占)的多态性,发现295对标记在2种籼稻间及2种粳稻间均带型一致,而在籼、粳亚种间有多态性,因此这套295对标记可以在涉及籼粳亚种的基因定位和分子育种中应用。

关键词:indel标记水稻基因定位

单位:华南农业大学生命科学学院/亚热带农业生物资源保护与利用重点实验室; 广东广州510642; 华南农业大学公共基础课实验教学中心; 广东广州510642

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