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玉米SNAC基因的遗传变异及耐旱性调控

李国君; 马艺文; 徐丹阳; 吴永波; 宋洁; 王楠; 郝转芳; 赵娟 作物学报 2017年第08期

摘要:以我国玉米育种中常用的16份自交系为材料,通过对SNAC(Stress-responsiveNAM,ATAF1/2,CUC2)基因编码区及上游启动子区800bp核苷酸序列进行测序,检测SNAC基因在不同杂种优势类群材料中的遗传变异。在12个SNAC基因中,其中有4个基因在上游800bp区检测到遗传变异,有4个基因变异位点超过30个,多态性较高。虽然大多数SNAC基因变异以SNP(Singlenucleotidepolymorphism)为主,但在ZmNAC031467基因中检测到较多的插入缺失变异(InDel),达到基因总遗传变异的63.3%。通过PLACE软件对上游启动子有变异的4个基因进行3种耐逆结合元件的预测,结果显示4个基因均含有3种耐逆结合元件,但是基因突变对启动子结合元件的影响较小。再对检测到的遗传变异进行核苷酸多态性分析和中性检验,有7个SNAC基因核苷酸多态性较高,其中ZmNAC080308基因的多态性达到0.00962,推测这些基因在遗传漂移过程中受自然选择影响较大。利用t检验初步发现ZmNAC070395和ZmNAC080398基因的2个变异位点与耐旱相关性状关联,为进一步分析SNAC基因核苷酸变异与耐旱性状的关系提供一定的借鉴。

关键词:玉米snac基因遗传变异耐旱性

单位:山西农业大学农学院; 山西太谷030801; 吉林省通化市农业科学研究院; 吉林梅河口135007; 中国农业科学院作物科学研究所; 北京100081

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