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玉米InDel标记20重PCR检测体系的建立

冯博; 许理文; 王凤格; 薛宁宁; 刘文彬; 易红梅; 田红丽; 吕远大; 赵涵; 金石桥; 张力科; 蔚荣海; 赵久然 作物学报 2017年第08期

摘要:为构建玉米多重PCR检测体系,提高分子标记检测效率,利用10份代表性玉米材料对238对InDel引物进行单重PCR评估,共得到192对扩增效率高、稳定性好的引物。根据软件评估结果、扩增质量、产物范围、染色体均匀分布原则从192对引物中优选出30对综合表现较好的引物形成扩增产物范围在80~200bp和200~400bp的两组核心引物组合,每套组合中有10对引物分布在不同染色体上。在核心引物组合的基础上综合考虑染色体分布、碱基片段范围、引物荧光颜色,逐一添加引物,最终形成两组玉米20重PCR体系,一组40重荧光标记毛细管电泳。

关键词:玉米indel多重pcr

单位:北京市农林科学院玉米研究中心/玉米DNA指纹及分子育种北京市重点实验室; 北京100097; 吉林农业大学农学院; 吉林长春130118; 江苏省农业科学院农业生物技术研究所; 江苏南京210014; 全国农业技术推广服务中心; 北京100125

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