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茶树EST-SSR的信息分析与标记建立

金基强; 崔海瑞; 陈文岳; 卢美贞; 姚艳玲; 忻雅; 龚晓春 茶叶科学 2006年第01期

摘要:在1589条茶树EST中,共发掘出了281个EST-SSR,分布于246条EST中,出现频率是17.68%,平均长度为33.06bp,平均分布频率是1,2.61kb。在茶树EST-SSR中,二核苷酸重复是主要的重复类型,出现最多的重复基元类型是AG/CT重复。设计了19对SSR引物,在对引物、dNTP、MgCl2的浓度及退火温度等参数进行测试后,建立了合适的PCR反应体系。以衍生绝大多数EST-SSR的龙井43DNA为模板,对引物进行了筛选,有16对引物显示扩增,可用率为84.2%;进一步在10个茶树品种中进行多态性测试,显现出多态性的引物占可扩增引物的62.5%。本文研究结果证明了根据茶树EST建立SSR标记是有效、可行的。

关键词:茶树estssr信息标记建立

单位:浙江大学原子核农业科学研究所; 浙江杭州310029; 杭州市农业科学院; 浙江杭州310024

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