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茶树PPO基因家族的鉴定与分析

曾泽媛; 罗勇; 郑楚楚; 李娟; 李勤; 林海燕; 王坤波 茶叶科学 2018年第04期

摘要:多酚氧化酶(Polyphenol oxidases,PPO)是由核酸编码的一种以氧为受体的含铜金属酶,为一种末端氧化酶,在茶叶加工中也发挥重要的作用。从最新的茶树基因组数据库中获得了5条PPO基因:CsPPO1、CsPPO2、CsPPO3、CsPPO4(GenBank登录号为GQ129142.1)、CsPPO5。本研究利用生物信息学方法,对5条基因的核酸序列和氨基酸序列进行分析,并对基因编码蛋白的理化性质和结构功能进行预测。结果表明,5个基因CDS区全长在597~1839bp之间,编码氨基酸数目198~612;系统进化树分析显示CsPPO1、CsPPO3、CsPPO4和CsPPO5具有较近的亲缘关系;编码的蛋白均属于亲水性不稳定类脂类结合蛋白,都不具有信号肽;无规则卷曲是蛋白质的主要结构元件,α-螺旋和β-折叠分散于整个多肽链中,CsPPO1、CsPPO2、CsPPO3可能存在一个或多个跨膜螺旋;5个蛋白均含有PPO1_DWL(pfam12142)保守结构域,除了CsPPO2外,其余4个蛋白均预测到TYROSINASE功能结构域。实时定量PCR结果表明,PPOs基因在不同茶树品种间呈现出不同的表达模式。

关键词:茶树多酚氧化酶基因家族序列分析

单位:湖南农业大学茶学教育部重点实验室; 湖南长沙410128; 国家植物功能成分利用工程技术研究中心; 湖南长沙410128; 湖南省植物功能成分利用协同创新中心; 湖南长沙410128

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