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正交设计优化番石榴属(Psidium)植物SSR-PCR反应体系和引物筛选

马泽华; 刘顺枝; 徐社金; 汪永红; 胡位荣 分子植物育种 2019年第24期

摘要:以4份番石榴属植物嫩叶为材料,利用L(16)(4~3)正交试验设计方法,对2×Taq Mix、模板DNA、引物浓度3个因素进行4个水平筛选。结果表明,反应各因素对SSR-PCR体系的影响程度为2×Taq Mix用量>DNA模板量>引物浓度,适合番石榴属植物SSR-PCR反应的最佳体系为20μL。反应体系包含了DNA模板40 ng、引物各0.3μmol/L、2×Taq Mix 10μL,ddH2O 4.8μL;运用该优化体系从23对SSR引物中筛选出21对扩增条带清晰、多态性良好的SSR引物,多态引物占比91.30%;利用9份番石榴种质验证了SSR-PCR体系具有较高的稳定性和重复性。

关键词:番石榴属正交设计引物筛选

单位:广州大学生命科学学院; 广州510006; 广州市果树科学研究所; 广州510405

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