摘要:本文提出了一个预测RNA二级结构的计算模型和动态规划算法.该算法采用子序列的组合策略和RNA二级结构的内在特性,计算多个平面伪结点和一个非平面伪结点结构.与Rivas算法相比,该算法减少了2n4的空间,并将时间复杂度由O(n6)降为O(n5).实验结果验证了算法的有效性.
关键词:rna二级结构 动态规划 热动力学
单位:山东大学计算机学院; 山东济南250100山; 东经济学院计算机学院; 山东济南250014; 山东大学计算机学院; 山东济南250100; 山东经济学院计算机学院; 山东济南250014
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