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蛋白质三维连续模型结构预测的高效算法

陈克宾; 黄文奇 计算机工程与科学 2007年第04期

摘要:为了解生物学上蛋白质的空间构成情况,通过对生物学上蛋白质实际空间组成结构的分析,本文提出了一种抽象的蛋白质三维结构连续数学模型与之对应,应用拟物的方法找到了对应于此数学模型的物理模型,并且用数学方法客观、精准地对该模型进行了公式表达,然后应用数学求最值的方法且结合一种优化算法对以上公式进行了有效的演算,并得到了比较好的结果。因此,我们就找到了相应的一种求解蛋白质三维构型的高效算法,应用该算法能更快更优地得到相应蛋白质链的近似最优构型。

关键词:蛋白质结构预测折叠引力势能局部最小能量

单位:华中科技大学计算机科学与技术学院; 湖北武汉430074

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