摘要:为提高分子对接精度与速度,设计并实现了基于自适应克隆选择算法的分子对接构象搜索策略.该策略用自适应克隆增殖算子、自适应变异算子、自适应重组算子更新了克隆选择算子、高频变异算子、重组算子,同时引入抗体浓度机制.为验证该对接方法的有效性,用此方法对布克海文蛋白质数据库中的六种蛋白质—配体复合物进行实验测试,并将实验结果与拉马克遗传算法、模拟退火算法、免疫遗传算法和简单克隆选择算法进行比较,结果表明该对接策略具有更快的收敛速度和更好的寻优能力.
关键词:分子对接 构象搜索策略 自适应 克隆选择算法 计算机辅助药物设计
单位:包头医学院医学技术学院; 内蒙古包头014040; 内蒙古师范大学传媒学院; 内蒙古呼和浩特010022; 内蒙古师范大学计算机与信息工程学院; 内蒙古呼和浩特010022
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