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生物信息学技术分析并克隆超级稻生长素结合蛋白cDNA

程鹏 蒋泓 欧阳琳 王若仲 肖浪涛 农业现代化研究 2008年第04期

摘要:为进一步研究超级稻的生长素结合蛋白,采用生物信息学方法获得其全长cDNA序列,并进行分析;对全长序列进行了全长验证。从数据库搜索获得了一条水稻cDNA序列,含一个推测的206个氨基酸的开放阅读框,与其它植物的ABP1cDNA序列和ABP1蛋白质序列具有明显的同源性,并且其推测编码的蛋白质的各种性质。类似于其它植物的ABP1。结果显示,该序列为水稻的ABP1cDNA。以该序列为指导,利用RT—PCR扩增超级稻ABP1cDNA,并克隆测序,其序列与电子搜索结果一致。

关键词:生物信息学超级稻生长素结合蛋白克隆

单位:湖南农业大学湖南省植物激素与生长发育重点实验室 湖南长沙410128 佛山科学技术学院 广东佛山528000 湖南农业大学生物科学技术学院 湖南长沙410128

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农业现代化研究

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