《Journal Of Molecular Graphics & Modelling》杂志在中科院中是3区。
具体分区如下：
大类学科：生物学
分区：3区
小类学科：生化研究方法生化研究方法、生化研究方法生化与分子生物学、生化研究方法计算机：跨学科应用、生化研究方法晶体学、生化研究方法数学与计算生物学
分区：3区、3区、4区、2区、3区
《新锐期刊分区表》（当前数据版本：2026年3月发布）
| 大类学科 | 分区 | 小类学科 | 分区 | Top期刊 | 综述期刊 |
| 生物学 | 3区 |
BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS
生化研究方法
BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
生化与分子生物学
COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS
计算机：跨学科应用
CRYSTALLOGRAPHY
晶体学
MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
数学与计算生物学
|
3区
3区
4区
2区
3区
|
否 | 否 |
期刊分区表（当前数据版本：2025年3月升级版）
| 大类学科 | 分区 | 小类学科 | 分区 | Top期刊 | 综述期刊 |
| 生物学 | 4区 |
CRYSTALLOGRAPHY
晶体学
BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS
生化研究方法
BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
生化与分子生物学
COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS
计算机：跨学科应用
MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
数学与计算生物学
|
2区
4区
4区
4区
4区
|
否 | 否 |
期刊分区表（当前数据版本：2023年12月升级版）
| 大类学科 | 分区 | 小类学科 | 分区 | Top期刊 | 综述期刊 |
| 生物学 | 4区 |
CRYSTALLOGRAPHY
晶体学
BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS
生化研究方法
BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
生化与分子生物学
COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS
计算机：跨学科应用
MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
数学与计算生物学
|
3区
4区
4区
4区
4区
|
否 | 否 |
名词释义：中科院分区是中国科学院国家科学图书馆制定，中科院分区目前分为基础版和升级版（试行），基础版先将JCR中所有期刊分为13大类学科，每个学科分类按照期刊的3年平均影响因子高低，分为4四个区；升级版将期刊分为18个大类学科，涵盖数学、物理与天体物理、化学、材料科学、地球科学等大类学科；升级版设计了“期刊超越指数”取代影响因子指标。期刊超越指数即本刊论文的被引频次高于相同主题、相同文献类型的其它期刊的概率。
其他影响力
影响因子：《Journal Of Molecular Graphics & Modelling》杂志的影响因子为3.1，这反映了该杂志在生物领域的学术影响力和认可度。
JCR分区中属于：Q2
按JCI指标学科分区学科：BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS，收录子集：SCIE，分区：Q2，排名：36 / 85BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY，收录子集：SCIE，分区：Q3，排名：192 / 328COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS，收录子集：SCIE，分区：Q3，排名：99 / 185CRYSTALLOGRAPHY，收录子集：SCIE，分区：Q2，排名：8 / 31MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY，收录子集：SCIE，分区：Q2，排名：18 / 67BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS，收录子集：SCIE，分区：Q2，排名：25 / 85BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY，收录子集：SCIE，分区：Q2，排名：93 / 328COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS，收录子集：SCIE，分区：Q2，排名：69 / 185CRYSTALLOGRAPHY，收录子集：SCIE，分区：Q1，排名：5 / 31MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY，收录子集：SCIE，分区：Q1，排名：14 / 67 ，按JCI指标学科分区学科：BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS，收录子集：SCIE，分区：Q2，排名：34 / 86BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY，收录子集：SCIE，分区：Q3，排名：169 / 320COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS，收录子集：SCIE，分区：Q2，排名：85 / 177CRYSTALLOGRAPHY，收录子集：SCIE，分区：Q1，排名：6 / 31MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY，收录子集：SCIE，分区：Q2，排名：17 / 67BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS，收录子集：SCIE，分区：Q2，排名：24 / 86BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY，收录子集：SCIE，分区：Q2，排名：83 / 321COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS，收录子集：SCIE，分区：Q2，排名：58 / 177CRYSTALLOGRAPHY，收录子集：SCIE，分区：Q1，排名：6 / 31MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY，收录子集：SCIE，分区：Q1，排名：15 / 67
Cite Score数值：6.1，SJR：0.498，SNIP：0.687
学科类别大类：Computer Science小类：Computer Graphics and Computer-Aided Design，分区：Q1。
学科类别大类：Computer Science小类：Spectroscopy，分区：Q2。
学科类别大类：Computer Science小类：Physical and Theoretical Chemistry，分区：Q2。
学科类别大类：Computer Science小类：Materials Chemistry，分区：Q2。
h-index：67，这一数字表明《Journal Of Molecular Graphics & Modelling》杂志在其研究领域内拥有相当数量的高质量学术论文，Gold OA文章占比：8.62%，则进一步揭示了该杂志在学术成果传播与共享方面的积极态度。
| 中科院同小类学科热门期刊 | 影响因子 | 中科院分区 | 浏览次数 |
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| Biotechnology Letters | 2.5 | 3区 | 5021 |
| International Journal Of Biological Macromolecules | 8.7 | 2区 | 4894 |
| Nature Ecology & Evolution | 17.1 | 1区 | 3884 |
| Biologia Futura | 2.1 | 4区 | 3407 |
| Bmc Genomics | 3.9 | 2区 | 3294 |
| Microbiology Spectrum | 4.1 | 2区 | 2836 |
| Environmental And Experimental Botany | 5.1 | 2区 | 2606 |
| New Phytologist | 8.7 | 1区 | 2585 |
| Frontiers In Microbiology | 5.8 | 2区 | 2568 |
