摘要:目的通过文献挖掘与生物信息学分析的方法,探讨Her2(+)/Her2(-)乳腺癌之间差异表达的microRNAs可能涉及的生物学功能和信号通路。方法在NCBI数据库的GEO子数据库及EBI数据库中的Array Express子数据库开展检索,使用关键词“breast cancer”、“microRNA”进行检索,获取Her2(+)/Her2(-)乳腺癌之间差异表达microRNAs。利用microRNAs靶基因预测软件预测所有差异表达microRNAs的靶基因,进行通路分析。结果找到2个在Her2表型不同的乳腺癌中差异表达的microRNAs数据集,利用软件TargetScan预测差异表达microRNAs的靶向基因,取其合集进行富集分析,最后将富集得到的基因利用David数据库进行分析,从而得到了上述差异表达的microRNAs可能具有的生物学功能和参与的调节通路。结论差异表达的microRNAs通过调节靶向基因参与不同信号通路,实现多种生物学功能。
关键词:乳腺肿瘤 受体 her2 小rna病毒 计算机生物学
单位:南方医科大学珠江医院肿瘤中心 广州510282
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