摘要：目的分析大鼠Pten和Runx3基因5’端非编码区（5’-UTR）序列的CpG岛、启动子及其转录因子结合位点。方法通过NCBI获得大鼠Pten和Runx3基因全长序列及转录本，采用Blast中的可读框比对外显子、内显子及上游5’-UTR信息，所获得ATG上游2kb、下游1kb序列分别应用CpGislandsearcher软件、CpGPlot工具、Methprimer2．0工具预测CpG岛，NNPP工具、Promoterscan工具、FirstEF工具预测启动子，Madspector、Match、Con—site预测启动子区域转录结合位点。结果大鼠Pten基因和Runx3基因属于CpG岛关联基因，启动子可能分别位于-1253～-684bp和-690～-121bp，Pten和Runx3基因在109和94种转录因子结合位点中，被≥2种软件共同预测有结合位点的转录因子分别有6和9种。结论初步获得大鼠Pten和Runx3基因5’-UTR序列的生物学信息，为进一步基因调控甲基化实验验证奠定了基础。

关键词：生物信息分析 runx3 pten 大鼠 

单位：北京中医药大学 北京100029 北京中医药大学第三附属医院 中华中医药学会