线上期刊服务咨询,发表咨询:400-808-1701 订阅咨询:400-808-1721

适用于大豆疫霉菌遗传分析的新EST-SSR标记

蔺宇 徐静静 王晓鸣 武小菲 李彦舫 朱振东 中国农业科学 2008年第08期

摘要:【目的】开发大豆疫霉菌SSR标记,为深入了解大豆疫霉菌遗传变异提供理想分析工具。【方法】用SSRIT软件对28197条大豆疫霉菌EST进行SSR搜索,选择含有SSR的合适EST设计、合成引物和PCR扩增。【结果】发现1454条EST含有SSR,其中3个碱基重复基元类型最多,有855个,占鉴定总数的54.3%。设计合成140对引物,用10个大豆疫霉菌菌株基因组DNA进行PCR检测,有111对引物(79.3%)扩增出SSR特征条带。通用性检测表明有33对引物在检测的1个或多个其它疫霉菌或腐霉菌中产生扩增产物。【结论】大豆疫霉菌EST含有丰富的SSR位点,本研究从EST中开发了111个新大豆疫霉菌SSR标记,可有效地用于大豆疫霉菌及其相关种的遗传变异研究。

关键词:大豆疫霉菌ssr标记通用性

单位:中国农业科学院作物科学研究所国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程 北京100081 吉林大学农学院 吉林长春130062

注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社

中国农业科学

北大期刊

¥1288.00

关注 25人评论|2人关注