摘要：【目的】开发可用于植物遗传多样性分析和遗传图谱构建的新型标记。【方法】根据植物结构基因内含子拼接位点的保守序列，设计扩增内含子的内含子-外显子拼接位点（intron targeted intron-exon splice junction，IT-ISJ）标记引物，并用于陆地棉遗传图谱构建。【结果】利用704个IT-ISJ引物组合，对陆地棉高品质品种渝棉1号和多显性基因标记系T586进行多态性筛选，获得49个多态性引物组合，占筛选引物的7．0％。49个多态性引物组合在（渝棉1号×T586）F2：7，重组近交系群体270个系中检测到58个位点。以58个IT-ISJ、150个SSR和8个形态标记进行连锁分析，构建的遗传连锁图包括22个连锁群、113个位点（49个IT-ISJ、62个SSR和2个形态标记）。连锁图覆盖714．5cM，占棉花基因组的16．1％，标记间平均长度为6．3cM。【结论】IT-ISJ标记多态性高，可有效地用于陆地棉遗传连锁图谱的构建。

关键词：陆地棉 遗传图谱 

单位：西南大学农学与生物科技学院农业部生物技术与作物品质改良重点实验室 重庆400716