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内蒙古绒山羊CRABPI基因的克隆及表达

李华 苏立宁 刘东军 李雪峰 旭日干 中国农业科学 2012年第13期

摘要:【目的】克隆内蒙古绒山羊视黄酸结合蛋白Ⅰ(cellular retinoic acid binding proteinⅠ,CRABPⅠ)基因的cDNA,进行蛋白结构的预测和表达分析,为绒山羊毛和绒形成的分子机理奠定基础。【方法】利用RT-PCR方法克隆内蒙古绒山羊CRABPⅠ基因序列,利用生物信息学方法预测其蛋白结构,采用实时荧光定量PCR探讨该基因在绒山羊4个胎儿日龄皮肤中的表达。【结果】内蒙古绒山羊CRABP I基因cDNA长679 bp(JN936490),其开放阅读框为414 bp,氨基酸序列与其它物种相比具有较高的序列相似性。CRABPⅠ蛋白无明显的信号肽和跨膜区域,不存在N糖基化位点和O糖基化位点;蛋白二级结构主要由α螺旋、β折叠和少量的转角及无规则卷曲构成。胎儿皮肤中CRABPⅠ基因在90 d的表达量明显高于100、120和130 d(P〈0.05)。【结论】绒山羊的CRABPⅠ基因cDNA中的开放阅读框(open reading frame,ORF)在不同物种间较为保守,但种属特异性集中表现在第33和123氨基酸残基处,该基因在胎儿期的90 d表达量最大。

关键词:绒山羊克隆基因表达生物信息学

单位:内蒙古大学生命科学院/哺乳动物生殖生物学及生物技术教育部重点实验室 呼和浩特010021 佛山科学技术学院 广东佛山528231 华南师范大学生命科学学院 广州510000 河北北方学院 河北张家口075000

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