摘要：【目的】研究半番鸭与番鸭精巢组织转录组差异表达基因,为进一步阐明半番鸭不育的遗传机制奠定理论基础。【方法】利用转录组测序方法对半番鸭和番鸭的精巢组织进行研究,筛选其差异表达基因,并对其功能进行注释和荧光定量PCR（quantitative real-time PCR,QRT-PCR）验证。【结果】测序共获得43.84Gb Clean Data,组装后共获得193 535条Unigene。DESeq分析发现3 597个基因在两个鸭品种间差异表达,其中上调基因1 194个和下调基因2 403个,包括与生殖功能相关的基因,如成纤维细胞生长因子（fibroblast growth factor,FGF）、蛋白激酶A（protein kinase A,PKA）、丝裂原活化蛋白激酶7（mitogen-activated protein kinase 7-like,partial,BMK）、生长因子受体结合蛋白2（growth factor receptor-bound protein 2,GRB2）、c-Jun氨基末端激酶（c-Jun N-terminal kinase,JNK）和肿瘤坏死因子受体超家族成员6（tumor necrosis factor receptor superfamily member 6,FAS）等。GO（gene Ontology）分析发现382个差异基因获得功能注释,其中97个基因涉及发育繁殖生物学过程。KEGG（kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）通路分析表明差异表达基因共富集到50条信号通路中,其中17个通路显著富集,包括丝裂原活化蛋白激酶信号转导通路（mitogen-activated protein kinase signaling pathway,MAPK）、甘油酯代谢（glycerolipid metabolism）以及钙信号途径（calcium signaling pathway）信号通路等,与生殖功能密切相关的有促性腺激素释放激素信号通路（gonadotropin releasing hormone（Gn RH）signaling pathway）和MAPK信号转导通路。经QRT-PCR验证,差异基因表达变化模式与转录组测序结果一致,测序结果可靠。【结论】在转录组水平上筛选出半番鸭和番鸭精巢组织差异表达基因,揭示了Gn RH和MAPK信号通路在鸭的生殖活动中发挥了重要作用,为进一步探索半番鸭生殖系统的分化机理提供可靠的参考依�

关键词：半番鸭 番鸭 精巢组织 差异表达基因 转录组 

单位：福建省农业科学院畜牧兽医研究所; 福州350013; 福建昌龙集团; 福建漳州363000; 福建农林大学食品科学学院; 福州351100