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渗透胁迫下水稻根系核仁小分子RNA转录本变化的全基因组表达分析

马廷臣 陈荣军 余蓉蓉 曾汉来 张端品 中国水稻科学 2012年第01期

摘要:利用Affymetrix水稻60k芯片研究了聚乙二醇6000(PEG)模拟干旱时,水稻根系核仁小分子RNA(snoRNA)转录本的表达活性变化。在模拟干旱胁迫下,水稻根系snoRNA转录本表达有很强的品种特异性,干旱敏感品种爱华5号中共有23个snoRNA转录本活性发生变化且均表现为上调表达,而耐早品种湘丰早119中仅有2个snoRNA转录本表达活性发生变化,也都为上调表达;转录活性发生变化的snoRNA转录本都为C/D框型,且在染色体上存在5处snoRNA簇;爱华5号和湘丰早119在模拟干旱胁迫下表达发生变化的snoRNA转录本有1个转录本重叠,且此转录本在爱华5号中表达活性是湘丰早119中的17.54倍。

关键词:基因芯片水稻根系核仁小分子rna转录本

单位:安徽省农业科学院水稻研究所/安徽省水稻遗传育种重点实验室/国家水稻改良中心合肥分中心 安徽合肥230031 华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室 湖北武汉430070 四川农业大学水稻研究所 四川成都611134

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