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重亚硫酸盐修饰直接测序技术检测p16基因甲基化的研究

张华; 府伟灵; 黄庆; 郭颖 重庆医学 2006年第03期

摘要:目的建立稳定的重亚硫酸盐直接测序技术,检测p16基因甲基化状况。方法提取正常人全血基因组DNA.建立起稳定的重亚硫酸盐直接测序平台,利用该技术检测结直肠癌细胞株pl6基因甲基化状况。结果应用列联表的Fisher,Exact Test比较3种纯化方法的测序结果,乙醇/醋酸钠和过柱纯化与SAP—ExonI纯化法比较,测序结果差异有统计学意义(P〈0.05);应用重亚硫酸盐直接测序技术,可检测出p16基因目的片段中CpG岛所有CpG位点的甲基化状况。结论应用SAP—ExonI纯化法,建立了稳定的重亚硫酸盐直接测序技术,并可检测出目的片段中CpG岛所有CpG位点的甲基化状况。

关键词:双脱氧测序法测序图谱

单位:第三军医大学西南医院检验科; 重庆400038; 现在贵州省人民医院检验科; 550000

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