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SELEX筛选LPS寡核苷酸适配子方法的建立

杨清武 文爱清 吕凤林 陈彩宇 重庆医学 2008年第16期

摘要:目的建立SELEX筛选LPS的适配子方法,为后续大规模筛选奠定基础。方法在成功构建含40个随机序列的单链DNA(ssDNA)文库的基础上,优化了扩增为双链DNA(dsDNA)文库的PCR反应争件;同时对液相筛选与固液相筛选两种方法进行比较,确定最优的筛选方法并进行4轮筛选。结果确定了扩增为双链DNA(dsDNA)文库的PCR反应的最佳条件,采用液相筛选方法经过4轮筛选,随机单链DNA(ssDNA)文库与内毒素(LPS)的结合率明显上升,CPM值与初始库相比差异有统计学意义。结论建立了SELEX筛选LPS寡核苷酸适配子的筛选方法。

关键词:随机ssdna文库寡核苷酸适配子lps

单位:第三军医大学大坪医院野战外科研究所神经内科 重庆400042

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